Objave

nature_isme

Objava v Nature Publishing group

V nadaljevanju predstavljene objave, nastale v Lapanjevem laboratoriju, so pretežno s področij: mikrobiologija, molekularna mikrobiologija, metagenomika, biofilmi in horizontalni prenos genov (HGT).

Izvirni znanstveni članki

FAVET, Jocelyne, LAPANJE, Aleš, GIONGO, Adriana, KENNEDY, Suzanne, et al. Microbial hitchhikers on intercontinental dust : catching a lift in Chad. The ISME journal, ISSN 1751-7362, 2013, vol. 7, issue 4, str. 850-867, ilustr., doi: 10.1038/ismej.2012.152. [COBISS.SI-ID 30514393]

Ostali izvirni znanstveni članki
  • GIONGO, Adriana, FAVET, Jocelyne, LAPANJE, Aleš, GANO, Kelsey A., et al. Microbial hitchhikers on intercontinental dust : high-throughput sequencing to catalogue microbes in small sand samples. Aerobiologia, ISSN 0393-5965, 2013, vol. 29, iss. 1, str. 71-84, ilustr., doi: 10.1007/s10453-012-9264-0. [COBISS.SI-ID 30514137]
  • KOVAČ VIRŠEK, Manca, HUBAD, Barbara, LAPANJE, Aleš. Mercury induced community tolerance in microbial biofilms is related to pollution gradients in a long-term polluted river. Aquatic toxicology, ISSN 0166-445X. [Print ed.], 2013, vol. 144-145, str. 208-217, doi: 10.1016/j.aquatox.2013.09.023. [COBISS.SI-ID 3029839]
  • ZRIMEC, Jan, KOPINČ, Rok, RIJAVEC, Tomaž, ZRIMEC, Tatjana, LAPANJE, Aleš. Band smearing of PCR amplified bacterial 16S rRNA genes : dependence on initial PCR target diversity. Journal of microbiological methods, ISSN 0167-7012. [Print ed.], Nov. 2013, vol. 95, no. 2, str. 186-194, doi: 10.1016/j.mimet.2013.08.002. [COBISS.SI-ID 30828249]
  • HUBAD, Barbara, LAPANJE, Aleš. The efficient method for simultaneous monitoring of the culturable as well as nonculturable airborne microorganisms. PloS one, ISSN 1932-6203, 2013, vol. 8, št. 12, str. 1-9; e82186, doi: 10.1371/journal.pone.0082186. [COBISS.SI-ID 3029583]
  • KUŠAR, Darja, PATE, Mateja, HUBAD, Barbara, AVBERŠEK, Jana, LOGAR, Katarina, LAPANJE, Aleš, ZRIMEC, Alexis, OCEPEK, Matjaž. Detection of Bacillus anthracis in the air, soil, and animal tissue. Acta veterinaria, ISSN 0567-8315, 2012, vol. 62, no. 1, str. 77-89. [COBISS.SI-ID 3508602]
  • KARAJIĆ, Milana, LAPANJE, Aleš, RAZINGER, Jaka, ZRIMEC, Alexis, VRHOVŠEK, Danijel, KATZ, Sidney A. Microbial activity in a pilot-scale, subsurface flow, sand-gravel constructed wetland inoculated with halotolerant microorganisms. African journal of biotechnology, ISSN 1684-5315, 2012, vol. 11, no. 84, str. 15020-15029. http://www.academicjournals.org/AJB. [COBISS.SI-ID 3946600]
  • LOGAR, Katarina, KOPINČ, Rok, BANDELJ, Petra, STARIČ, Jože, LAPANJE, Aleš, OCEPEK, Matjaž. Evaluation of combined high-efficiency DNA extraction and real-time PCR for detection of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in subclinically infected dairy cattle : comparison with faecal culture, milk real-time PCR and milk ELISA. BMC veterinary research, ISSN 1746-6148, May 2012, vol. 8, art. no. 49, str. 1-22. http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1746-6148-8-49.pdf, doi: 10.1186/1746-6148-8-49. [COBISS.SI-ID 3525498]
  • KRALJ KUNČIČ, Marjetka, JAKLIČ, Domen, LAPANJE, Aleš, GUNDE-CIMERMAN, Nina. Antibacterial and antimycotic activities of Slovenian honeys. British journal of biomedical science, ISSN 0967-4845, 2012, vol. 69, no. 4, str. 154-158. [COBISS.SI-ID 30514649]
  • KOPINČ, Rok, LAPANJE, Aleš. Antibiotic susceptibility profile of Mycobacterium avium subspecies hominissuis is altered in low-iron conditions. Journal of antimicrobial chemotherapy, ISSN 0305-7453, Aug. 2012, vol. 67, iss. 12, str. 2903-2907, doi: 10.1093/jac/dks313. [COBISS.SI-ID 30327001]
  • HUBAD, Barbara, LAPANJE, Aleš. Inadequate hospital ventilation system increases the risk of nosocomial Mycobacterium tuberculosis. The Journal of hospital infection, ISSN 0195-6701, 2012, vol. 80, no. 1, str. 88-91, doi: 10.1016/j.jhin.2011.10.014. [COBISS.SI-ID 29609177]
  • TRAUNŠEK, Urban, TOPLAK, Nataša, JERŠEK, Barbara, LAPANJE, Aleš, MAJSTOROVIĆ, Tamara, KOVAČ, Minka. Novel cost-efficient real-time PCR assays for detection and quantitation of Listeria monocytogenes. Journal of microbiological methods, ISSN 0167-7012. [Print ed.], 2011, vol. 85, issue 1, str. 40-46, doi: 10.1016/j.mimet.2011.01.018. [COBISS.SI-ID 3871608]
  • LAPANJE, Aleš, WIMMERSBERGER, Celine, FURRER, Gerhard, BRUNNER, Ivano, FREY, Beat. Pattern of elemental release during the granite dissolution can be changed by aerobic heterotrophic bacterial strains isolated from damma glacier (Central Alps) deglaciated granite sand. Microbial ecology, ISSN 0095-3628, 2012, vol. 63, iss. 4, str. 865-882, ilustr., doi: 10.1007/s00248-011-9976-7. [COBISS.SI-ID 29196249]
  • OCEPEK, Matjaž, PATE, Mateja, KUŠAR, Darja, HUBAD, Barbara, AVBERŠEK, Jana, LOGAR, Katarina, LAPANJE, Aleš, ZRIMEC, Alexis. Comparison of DNA extraction methods to detect Salmonella spp. in tap water. Slovenian veterinary research, ISSN 1580-4003. [English ed.], 2011, vol. 48, no. 3/4, str. 93-98. [COBISS.SI-ID 3485306]
  • FREY, Beat, RIEDER, Stefan R., BRUNNER, Ivano, PLÖTZE, Mihael, KOETZSCH, Stefan, LAPANJE, Aleš, BRANDL, Helmut, FURRER, Gerhard. Weathering-associated bacteria from the Damma glacier forefield: physiological capabilities and impact on granite dissolution. Applied and environmental microbiology, ISSN 0099-2240, 2010, vol. 76, no. 14, str. 4788-4796, doi: 10.1128/AEM.00657-10. [COBISS.SI-ID 27512537]
  • LAPANJE, Aleš, ZRIMEC, Alexis, DROBNE, Damjana, RUPNIK, Maja. Long-term Hg pollution-induced structural shifts of bacterial community in theterrestrial isopod (Porcellio scaber) gut. Environmental pollution, ISSN 0269-7491. [Print ed.], 2010, vol. 158, no. 10, str. 3186-3193. http://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2010.07.001, doi: 10.1016/j.envpol.2010.07.001. [COBISS.SI-ID 6394233]
  • KARAJIĆ, Milana, LAPANJE, Aleš (pisar), RAZINGER, Jaka, ZRIMEC, Alexis, VRHOVŠEK, Danijel. The effect of the application of halotolerant microorganisms on the efficiency of a pilot-scale constructed wetland for saline wastewater treatment. Journal of the Serbian Chemical Society, ISSN 0352-5139, 2010, vol. 75, no. 1, str. 129-142. [COBISS.SI-ID 1380347]
  • BERNASCONI, Stefano M., LAPANJE, Aleš, et al. Weathering, soil formation and initial ecosystem evolution on a glacier forefield: a case study from the Damma Glacier, Switzerland. V: Eighth international symposium on the geochemistry of the eart’s surface : GES8 : Natural History Museum, London, 18-22 August, 2008, (Mineralogical magazine (Print), ISSN 0026-461X, Vol. 72, Issue 1, 2008). London: Mineralogical Society, 2008, vol. 72, iss. 1, str. 19-22, doi: 10.1180/minmag.2008.072.1.19. [COBISS.SI-ID 27324633] tipologija 1.08 -> 1.01
  • LAPANJE, Aleš, DROBNE, Damjana, NOLDE, Nataša, VALANT, Janez, HUBAD, Barbara, LEŠER, Vladka, RUPNIK, Maja. Long-term HG pollution induced Hg tolerance in the terrestrial isopod Porcellio scaber (Isopoda, Crustacea). Environmental pollution, ISSN 0269-7491. [Print ed.], 2008, vol. 153, no. 3, str. 537-547. http://dx.doi.org/10.1016/j.envpol.2007.09.016, doi: doi:10.1016/j.envpol.2007.09.016. [COBISS.SI-ID 1850703]
  • JAKLIČ, Domen, LAPANJE, Aleš, ZUPANČIČ, Klemen, SMRKE, Dragica, GUNDE-CIMERMAN, Nina. Selective antimicrobial activity of maggots against pathogenic bacteria. Journal of medical microbiology, ISSN 0022-2615, 2008, vol. 57, iss. 5, str. 617-625. [COBISS.SI-ID 1869391]
  • JAKLIČ, Domen, ZUPANČIČ, Klemen, LAPANJE, Aleš, SMRKE, Dragica, CIMERMAN, Matej, PARAĆ, Zlatko, ARNEŽ, Zoran M., GUNDE-CIMERMAN, Nina. Uvedba zdravljenja kroničnih ran z ličinkami muh Lucilia sericata v Slovenijo = Introduction of chronical wounds healing with Lucilia sericata larvae in Slovenia. Zdravniški vestnik, ISSN 1318-0347. [Tiskana izd.], 2008, letn. 77, št. 3, str. 199-206. [COBISS.SI-ID 1869135]
  • RIJAVEC, Tomaž, LAPANJE, Aleš, DERMASTIA, Marina, RUPNIK, Maja. Isolation of bacterial endophytes from germinated maize kernels. Canadian journal of microbiology, ISSN 0008-4166, 2007, vol. 53, str. 802-808. [COBISS.SI-ID 1749327]
  • LAPANJE, Aleš, RUPNIK, Maja, DROBNE, Damjana. Gut bacterial community structure (Porcellio scaber, Isopoda, Crustacea) as a measure of community level response to long-term and short-term metal pollution. Environmental toxicology and chemistry, ISSN 0730-7268, 2007, vol. 26, no. 4, str. 755-763. [COBISS.SI-ID 1689423]
  • KOSTANJŠEK, Rok, LAPANJE, Aleš, DROBNE, Damjana, PEROVIĆ, Svetlana, PEROVIĆ, A., ZIDAR, Primož, ŠTRUS, Jasna, HOLLERT, H., KARAMAN, Gordan S. Bacterial community structure analyses to assess pollution of water and sediments in the lake Shkodra/Skadar, Balkan Peninsula. Environmental science and pollution research international, ISSN 0944-1344. [Print ed.], 2005, letn. 12, št. 6, str. 361-368. [COBISS.SI-ID 19967193]
  • VILISICS, Ferenc, LAPANJE, Aleš. Terrestrial isopods (Isopoda: Oniscidea) from the Slovenian Karst. Natura Sloveniae, ISSN 1580-0814. [Tiskana izd.], 2005, št. 1, vol. 7, str. 13-21. [COBISS.SI-ID 1604431]
  • KOSTANJŠEK, Rok, LAPANJE, Aleš, RUPNIK, Maja, ŠTRUS, Jasna, DROBNE, Damjana, AVGUŠTIN, Gorazd. Anaerobic bacteria in the gut of terrestrial isopod crustacean Porcellio scaber. Folia microbiologica, ISSN 0015-5632. [Print ed.], 2004, vol. 49, no. 2, str. 179-182. [COBISS.SI-ID 1390159]
  • DROBNE, Damjana, RUPNIK, Maja, LAPANJE, Aleš, ŠTRUS, Jasna, JANC, Miha. Isopod gut microflora parameters as endpoints in toxicity studies. Environmental toxicology and chemistry, ISSN 0730-7268, 2002, vol. 21, no. 3, str. 604-609. [COBISS.SI-ID 1047631].
  •  

    Pregledni znanstveni članek

    RIJAVEC, Tomaž, DERMASTIA, Marina. Cytokinins and their function in developing seeds. Acta chim. slov.. [Tiskana izd.], 2010, vol. 57, no. 3, str. 617-629. http://acta.chem-soc.si/57/57-3-617.pdf. [COBISS.SI-ID 2264911], [JCR, WoS do 5. 3. 2011: št. citatov (TC): 0, čistih citatov (CI): 0, normirano št. čistih citatov (NC): 0, Scopus do 14. 4. 2011: št. citatov (TC): 0, čistih citatov (CI): 0, normirano št. čistih citatov (NC): 0] kategorija: 1A3 (Z1); uvrstitev: SCI, Scopus, MBP; tipologijo je verificiral OSICB točke: 37.78, št. avtorjev: 1/2.

     

    Kratki znanstveni prispevek

    HUBAD, Barbara, BERDEN ZRIMEC, Maja, ZRIMEC, Alexis, LAPANJE, Aleš. Bakterijska združba v ustekleničeni vodi : uporaba molekularnih metod za mikrobiološko analizo ustekleničene vode z neprijetnim vonjem = Bacterial association in bottled water : use of molecular methods for microbiological analysis of bottled water with unpleasant smell. Sodobni vojaški izzivi, apr. 2011, 13, št. 1, str. 61-71, ilustr. http://www.slovenskavojska.si/fileadmin/slovenska_vojska/pdf/bilten_sv/svi_13_1.pdf. [COBISS.SI-ID 3973582].

     

    Strokovni članki

    RIJAVEC, Tomaž. Novi rekorder med genomi. Gea, jan. 2011, letn. 21, str. 14-15, ilustr. [COBISS.SI-ID 28178393] kategorija: SU (S) točke: 5, št. avtorjev: 1/1.

    Ostali strokovni članki
  • RIJAVEC, Tomaž. Projekt “Človeški genom” deset let pozneje. Gea, jul. 2011, letn. 21, št. jul, str. 12-15. [COBISS.SI-ID 29138649] kategorija: SU (S) točke: 5, št. avtorjev: 1/1. 
  • HUBAD, Barbara. Mikrobi v zraku. Proteus, maj-jun. 2011, letn. 73, št. 9/10, str. 438-445, ilustr. [COBISS.SI-ID 32845613] kategorija: SU (S) točke: 5, št. avtorjev: 1/1
  • RIJAVEC, Tomaž. Rubisco – skladiščnik ogljikovega dioksida na zemlji. Gea, nov. 2010, letn. 20, str. 17-19, ilustr. [COBISS.SI-ID 28178137] kategorija: SU (S) točke: 5, št. avtorjev: 1/1
  • BERDEN ZRIMEC, Maja, ZRIMEC, Alexis, LAPANJE, Aleš. Mikrobna revolucija : tema meseca. Gea, jul. 2010, letn. 20, št. 7, str. 15-21, fotogr. [COBISS.SI-ID 1096891486] kategorija: SU (S) točke: 1.67, št. avtorjev: 1/3
  • RIJAVEC, Tomaž. Poznate hormone v rastlinah?. Proteus, sep. 2010, letn. 73, št. 1, str. 24-36, ilustr. [COBISS.SI-ID 31746349] kategorija: SU (S) točke: 5, št. Avtorjev: 1/1
  • ZUPANČIČ, Klemen, JAKLIČ, Domen, LAPANJE, Aleš. Zdravljenje ran z ličinkami muh. Proteus, ISSN 0033-1805, mar. 2005, letn. 67, št. 7, str. 299-306, ilustr. [COBISS.SI-ID 23861805]
  • LAPANJE, Aleš. Sulfat reducirajoče bakterije, vse bolj zanimive. Proteus, ISSN 0033-1805, maj-jun. 2001, letn. 63, št. 9/10, str. 451-456, ilustr. [COBISS.SI-ID 18158637]
  • RIJAVEC, Tomaž. Bakterijski endofiti. Proteus, ISSN 0033-1805, mar. 2006, letn. 68, št. 7, str. 294-299, ilustr. [COBISS.SI-ID 25012781]
  • PAGON, Nives, RIJAVEC, Tomaž. Letni cikli srnjadi. Proteus, ISSN 0033-1805, dec. 2006, letn. 69, št. 4, str. 150-157, ilustr. [COBISS.SI-ID 25989933].
  •  

    Knjige in poglavja v knjigah

    Rijavec, Tomaž, Li, Qin-Bao, Dermastia, Marina, Chourey S., Prem. Cytokinins and Their Possible Role in Seed Size and Seed Mass Determination in Maize. In: G. Montanaro and B. Dichio (Eds.) Advances in Selected Plant Physiology Aspects, InTech: 388, 2012. (download pdf).

    Poglavja v knjigah
  • BERDEN ZRIMEC, Maja, DRINOVEC, Luka, ZRIMEC, Alexis. Delayed fluorescence. In: D.J. Suggett, O. Prasil, and M.A. Borowitzka (Eds.) Chlorophyll a Fluorescence in Aquatic Sciences: Methods and Applications. Springer, Dordrecht, Heidelberg, London, New York, pp. 293-310, 2010
  • BERDEN ZRIMEC, Maja. Detection methods for hazardous biological agenses in food and water. Institute of Physical Biology, Grosuplje. In Slovene, pp. 55, 2009.
  • MUSCET, Barbara, LAPANJE, Ales. Microbial populations in food and water. V: BERDEN ZRIMEC, Maja (Ed.) Detection methods for hazardous biological agenses in food and water. Institute of Physical Biology, Grosuplje, pp. 40-48, 2009
  • BERDEN ZRIMEC, Maja, BARLIC-MAGANJA, Darja. Biological detection systems in veterinary science and microbiology. Institute of Physical Biology, Grosuplje. In Slovene, pp. 102, 2007.
  •  

    Patenti

    KOPRIVNIKAR, Monika, LAPANJE, Aleš. Sistem za raziskovanje mikrobnih interakcij : patent : [št. patenta] SI 23804 A, 31. 01. 2013. Ljubljana: Urad Republike Slovenije za intelektualno lastnino, 2013. [COBISS.SI-ID 30515673] kategorija: SU (S) točke: 5, št. avtorjev: 1/2.

    Ostali patenti
  • LAPANJE, Aleš, KOPINČ, Rok. Postopek za ekstrakcijo DNK mikroorganizmov iz živil : patent št. SI 23734 A, datum objave prijave 31.11.2012; patentna prijava št. P-201200047z dne 17. 2. 2012. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2012. [COBISS.SI-ID 30385625] kategorija: SU (S) točke: 10, št. avtorjev: 2/2
  • LAPANJE, Aleš, HALOŽAN, David. Izboljšano zbiranje fluorescentne svetlobe iz vzorca med pomnoževanjem v RT-PCR : SI 23321 (A), 2011-09-30. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2011. 9 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 27382233] kategorija: SU (S) točke: 5, št. avtorjev: 1/2
  • LAPANJE, Aleš. Postopek in mešanica kemikalij za izolacijo nukleinskih kislin iz kompleksnih vzorcev : patentna prijava št. P-200700310 z dne 28.11.2007 : patent št. SI 22679 A z dne 30. 6. 2009. Ljubljana: Urad Republike Slovenije za intelektualno lastnino, 2009. 16 str., [ilustr.]. [COBISS.SI-ID 24160217] kategorija: SU (S) točke: 10, št. avtorjev: 1/1.
  •  

    Patentne prijave

    LAPANJE, Aleš. Avtomatizacija izolacije nukleinskih kislin iz kompleksnih vzorcev : številka prijave: P-201000223 z dne 26.7.2010. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2010. 8 str., [ilustr.]. [COBISS.SI-ID 27534553] kategorija: SU (S) točke: 0, št. avtorjev: 1/1

    Ostale patentne prijave
  • LAPANJE, Aleš. Postopek za hitro genotipizacijo sevov Mycobacterium avium podvrste paratuberculosis : številka prijave: 201000231, z dne 28.7.2010. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2010. 10 str., [ilustr.]. [COBISS.SI-ID 27534297] kategorija: SU (S) točke: 0, št. avtorjev: 1/1
  • LAPANJE, Aleš. Postopek za koncentriranje celic ter izolacijo nukleinskih kislin iz polimernega matriksa za analizo celic iz zraka : številka prijave: P-20100233 z dne 29.7.2010. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2010. 9 str., [ilustr.]. [COBISS.SI-ID 27534041] kategorija: SU (S) točke: 0, št. avtorjev: 1/1
  • LAPANJE, Aleš. Probiotična voda : voda z dodanimi mikroorganizmi : številka prijave: P-201000221 z dne 26.7.2010. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2010. 5 str. [COBISS.SI-ID 27534809] kategorija: SU (S) točke: 0, št. avtorjev: 1/1
  • LAPANJE, Aleš. Sistem za hitro preverjanje prisotnosti gojljivih mikroorganizmov v vzorcih in odkrivanje novih razmer za gojenje mikroorganizmov na majhnem prostoru : številka prijave: P-201000222 z dne 26.7.2010. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2010. 8 str., [ilustr.]. [COBISS.SI-ID 27535065] kategorija: SU (S) točke: 0, št. avtorjev: 1/1
  • JAKLIČ, Domen, LAPANJE, Aleš, ZUPANČIČ, Klemen, GUNDE-CIMERMAN, Nina. Clinical application of Lucilia sericata larval excreta/secreta for chronic wound treatment. Chicago: United States Patent and Trademark Office, Feb. 6, 2009. 3 str. [COBISS.SI-ID 25581273] kategorija: SU (S) točke: 2.5, št. avtorjev: 1/4
  • LAPANJE, Aleš. Visoko zmogljiva izolacija nukleinskih kislin. Ljubljana: Urad RS za intelektualno lastnino, 2009. 7 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 27382745] kategorija: SU (S) točke: 0, št. avtorjev: 1/1.
  •  

    Predavanje na tuji univerzi

    LAPANJE, Aleš. Are bacterial communities transformed by mercury or it is all around? : Johannes Gutenberg-Universität Mainz, Institut für Anorganische und Amalytische Chemie, 11 May 2010, Mainz. 2010. [COBISS.SI-ID 27625945] kategorija: SU (S) točke: 2, št. avtorjev: 1/1.

     

    Intervju

    LAPANJE, Aleš (intervjuvanec), PETRIČ, Blaž (intervjuvanec). Mikrobi: sovražniki in “antibiotiki” prihodnosti : metagenomski center : kako bolje razumeti različne vidike horizontalnega prenosa genov na ravni celic. Delo, ISSN 0350-7521, 27. feb. 2014, leto 56, št. 48, str. 14, ilustr. [COBISS.SI-ID 3065679].

     

    Glej tudi:
    Raziskovalni projekti
    Diplomska, magistrska dela in doktorske dizertacije